Cáo trạng của Viện Kiểm sát Nhân dân tỉnh thể hiện, từ tháng 6/2020 - 1/2021, trên địa bàn TP. Hồ Chí Minh và tỉnh Phú Yên, Ngô Công Trứ thông qua mạng xã hội, biết rõ tổ chức “Chính phủ quốc gia Việt Nam lâm thời”, là tổ chức phản động lưu vong do Đào Minh Quân đang sống tại Mỹ cầm đầu, nhưng Trứ đã đồng tình, ủng hộ cương lĩnh, điều lệ. Đồng thời, làm đơn tự nguyện tham gia tổ chức và được kết nạp là thành viên nhằm cùng tổ chức này xóa bỏ vai trò lãnh đạo của Đảng, lật đổ Nhà nước dưới nhiều hình thức khác nhau.
Ngoài ra, Ngô Công Trứ còn kích động, nói xấu lãnh tụ và vận động nhiều người tham gia tổ chức “Chính phủ quốc gia Việt Nam lâm thời”, nhằm lật đổ chế độ và Nhà nước ta./.