Theo Sở Dân tộc và Tôn giáo tỉnh Khánh Hòa, một trong những vướng mắc lớn nhất là tỷ lệ giải ngân nguồn vốn, đặc biệt là vốn sự nghiệp ở nhiều địa phương rất thấp (chủ yếu giải ngân nguồn vốn năm 2024 chuyển sang, nguồn vốn năm 2025 chưa giải ngân).

Nguyên nhân chủ yếu là sau khi hợp nhất 2 tỉnh từ ngày 1/7/2025, HĐND tỉnh Khánh Hòa mới thông qua Nghị quyết điều chỉnh kế hoạch đầu tư công trung hạn giai đoạn 2021 - 2025 và năm 2025. Nguồn vốn sự nghiệp năm 2025 của tỉnh Ninh Thuận (cũ) mới được phân bổ cho các sở, ngành, địa phương vào giữa tháng 6/2025 và tỉnh Khánh Hòa (cũ) mới được phân bổ vào tháng 8/2025.

Sau khi thực hiện chính quyền địa phương 2 cấp, các văn bản quy phạm pháp luật của Trung ương và địa phương liên quan đến Chương trình chưa được ban hành kịp thời, thiếu văn bản hướng dẫn cụ thể nên gây ra sự chậm trễ, lúng túng. Hệ thống tổ chức tại cơ sở cũng chưa được kiện toàn...

Để khắc phục những khó khăn trên và đẩy nhanh tiến độ thực hiện Chương trình, Sở Dân tộc và Tôn giáo Khánh Hòa kiến nghị Chính phủ sớm sửa đổi, bổ sung Nghị định số 27/2022/NĐ-CP ngày 19/4/2022 quy định cơ chế quản lý, tổ chức thực hiện các chương trình mục tiêu quốc gia và Nghị định số 38/2023/NĐ-CP sửa đổi bổ sung một số điều của Nghị định số 27/2022/NĐ-CP, sửa đổi một số nhiệm vụ giao cho UBND cấp huyện, để địa phương có căn cứ triển khai thực hiện.